HKEY_CLASSES_ROOT (HKCR)
Я не буду дублировать весьма подробное описание этой ветви реестра, данное . Ознакомьтесь с ним самостоятельно. Я его интерпретирую следующим образом. Если вы хотите, чтобы изменения затронули всех пользователей (включая будущих), то либо импортируйте HKCR ключи вместе с HKCU из cmdlines.txt, либо импортируйте ключи в раздел HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Classes при первом входе в систему.